Om prosjektet
Uvealt melanom (UM) er den vanligste kreftformen i øyet hos voksne. Til tross for lokal behandling av tumoren utvikler omtrent 50% av pasientene metastaser. Metastasene oppstår hovedsakelig i lever (~90 %), og er assosiert med en svært dårlig prognose, der median overlevelse er under 1 år. Dette understreker et betydelig behov for videreutvikling av metoder for diagnostikk og muligheter for å kunne følge behandlingseffekt og avdekke sykdomsprogresjon.
I denne sammenhengen har sirkulerende tumor-DNA (ctDNA) blitt foreslått som en lovende biomarkør. ctDNA er små DNA-fragmenter som frigjøres fra tumorceller til blodet, og kan dermed representere en «flytende biopsi» av tumoren. Deteksjon av ctDNA baserer seg på identifikasjon av tumorspesifikke mutasjoner. Ved UM inkluderer disse GNAQ, GNA11, PLCB4 og CYSLTR2. Mutasjonene er gjensidig utelukkende, som betyr at kun én av mutasjonene er til stede i tumor. Over 90% av pasientene har mutasjoner i GNAQ eller GNA11.
I prosjektet isoleres cellefritt DNA fra blod (plasma) til pasienter med UM. Dette analyseres ved hjelp av digital dråpe PCR (ddPCR), en svært sensitiv analysemetode der prøven deles opp i tusenvis av små dråper for tusenvis av PCR reaksjoner. Dråpene analyseres individuelt for å kunne detektere mutasjon/ctDNA. Metoden gjør det mulig å kvantifisere svært lave nivåer av ctDNA i plasma og beregne mengde ctDNA i blodet. Formålet med prosjektet er å undersøke hvor tidlig ctDNA fra pasienter med UM kan påvises i blod, og hvorvidt metoden kan benyttes til sanntidsoppfølging av behandlingseffekt og sykdomsprogresjon reflektert ved endringer i mengde ctDNA i blodet.
Bilder:
- Uvealt melanom. Oversikt over tumorens lokalisasjoner i uvea, med høyest forekomst i årehinnen (90 %), etterfulgt av strålelegemet (6 %) og regnbuehinnen (4 %). Figuren er utarbeidet av Geir Qvale og modifisert. Bildet er brukt med tillatelse fra Oslo Universitetssykehus.
- Flytende biopsi av tumor. DNA-fragmenter fra tumor kan sirkulere i blodsirkulasjonen, og fanges opp med en blodprøve som en flytende biopsi. Illustrasjonen er laget av Tina Galdal Tollefsen ved bruk av BioRender.
Prosjektdeltakere
Bjørg Eva Lund og Tina Galdal Tollefsen
Om oppdragsgiveren
EYETEC- Molecular Technology in Eye Research er en av fem forskningsgrupper ved øyeavdelingen ved Oslo universitetssykehus. EYETEC er ledet av Agate Noer som også er enhetsleder for Norsk hornhinnebank og har driftsansvar for laboratoriefløyen der alt er samlokalisert i bygg 36 i 4.etasje ved øyeavdelingen. Forskningsgruppen jobber tverrfaglig og består av forskere, klinikere, PhD studenter, ingeniør og forskerlinjestudent. EYETEC undersøker øyesykdommer ved “state of the art” molekyære teknologier, med et spesielt fokus på uvealt melanom. Målet er å øke forståelsen av sykdomsmekanismer, identifisere nye prognostiske og diagnostiske biomarkører, og bidra til utviklingen av mer målrettede og effektive behandlinger av øyesykdommer.
Gruppens prosjekter inkluderer studier av genetiske og epigenetiske endringer, bruk av CRISPR-Cas9-teknologi og analyser av tumorbiologi og mikromiljø gjennom enkeltcelle- og spatial transkriptomikk. Forskningen er også rettet mot bruk av flytende biomarkører slik som sirkulerende tumor DNA og ekstracellulære vesikler. I tillegg, jobber gruppen innen regenerativ medisin for behandling av forskjellige øyesykdommer.
Veileder
Nina Marie Pedersen, Høgskolen i Østfold
Agate Noer, Oslo universitetssykehus